EZB miRNA加尾法逆转录试剂盒原理
109 人阅读发布时间:2024-08-22 09:59
EZB miRNA加尾法逆转录试剂盒,来自EZB公司(公司全称EZBioscience),下面让我们来详细了解一下加尾法吧!
一、EZB miRNA介绍
miRNA,全名MicroRNA,是一种大小约21-23个碱基的单链小分子RNA,是由具有发夹结构的约70-90个碱基大小的单链RNA前体经过Dicer酶加工后生成。miRNA主要与靶基因mRNA3’端非编码区域特异性结合,调控转录后靶基因mRNA的翻译过程,从而阻断mRNA翻译和促进mRNA降解导致蛋白质表达降低。 miRNA的作用涉及个体发育、组织分化、细胞增殖和细胞凋亡等多种心血管疾病的发生发展。
成熟的miRNA的长度只有20nt左右,通常正向引物就会覆盖其全长甚至会有多余部分,反向引物就无处安置了。目前市面上解决方案就是在反转录时设法增加反转录产物长度。常见的方法有加尾法和茎环法,可以根据不同需求选择。
二、EZB miRNA加尾法逆转录试剂盒原理
EZB miRNA加尾法,利用PolyA 聚合酶为成熟的miRNA加上PolyA 尾,以带有通用序列的Oligo-dT作为反转录引物,合成加长miRNA对应的cDNA第一链。加尾法由PolyA聚合酶和逆转录酶两个酶共同作用完成。PolyA聚合酶负责给miRNA加上PolyA尾,增加其长度。之后逆转录引物结合到PolyA序列上,由逆转录酶完成加长版cDNA的合成。
三、EZB miRNA加尾法正向引物的设计
① 建议根据完整miRNA序列设计miRNA正向特异性引物,并将其中的U替换为T。
② 由于决定miRNA特异性的差异碱基大多都在3’端,同家族的miRNA基本在5’端序列相近,若根据miRNA序列设计的正向特异性引物退火温度过低,建议在引物5’端增加几个碱基(以G和C为主),增加碱基后需要验证一下特异性是否发生变化,以免造成非特异性扩增。如果出现引物退火温度过高的情况,建议删去5’端几个碱基。
③ 对于miRNA前体等长片段非特异性扩增,建议在正向特异性引物3’端增加1 ~ 3个A碱基。因为miRNA前体的部分序列和miRNA的序列是一样的,唯一的区别就是Poly(A)聚合酶发挥作用之后,miRNA序列后有连续A碱基组成的PolyA尾,而miRNA前体中与miRNA一致的序列后面不是连续的A碱基。在后续定量时,上游引物3’端增加1 ~ 3个A碱基可以避免miRNA前体的非特异扩增。
④ 对于序列相似的miRNA,决定其特异性的差异碱基大多都在3’端,建议正向特异性引物3’端需要终止于差异碱基,若由于引物长度过短而导致退火温度过低,可在引物5’端增加几个碱基,使上下游引物Tm值匹配。
四、部分EZB产品列
| 货号 |
产品 |
价格 |
| EZB-RN5 |
Fast Tissue RNA Purification Kit |
询价 |
| EZB-TZ1 |
Total RNA Extraction Reagent |
询价 |
| EZB-RN001A |
Tissue RNA Purification Kit |
询价 |
| EZB-VRN1 |
Viral RNA Purification Kit |
询价 |
| B0004D |
EZ-press RNA Purification Kit |
询价 |
| EZB-RN4 |
Universal RNA Purification Kit |
询价 |
| B0006 |
EZ-press Whole Blood RNA Purification Kit |
询价 |
| B0009 |
EZ-press DNA&RNA Purification Kit |
询价 |
| EZB-RN001 |
Tissue RNA Purification Kit |
询价 |