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荧光定量 PCR 平台期,有or没有?
447 人阅读发布时间:2022-04-02 15:28
荧光定量 PCR 实验中,童靴们会问是不是需要跑到平台期?如果没有平台期,是不是试剂不行?或者是扩增出现了问题?增加 PCR 循环数达到平台期,能不能行?没有对比就没有伤害,下面的对比实验会说明平台期到底是否会影响定量结果,又有哪些因素会影响到扩增曲线的平台期呢?
下图1是一组 6 个梯度稀释的标准品,扩增曲线指数期之后是线性扩增期,从图上看,没有出现明显的平台期。这样的结果能否得到理想的标准曲线用于定量分析呢?
定量 PCR 的数学原理中指出,荧光定量 PCR 是在扩增曲线的指数期内划定阈值线,取阈值线与扩增曲线的交点所得到的 Ct 值(图 2)进行定量分析。之前的实验证明:96 次重复实验(图 3)说明 PCR 反应的终产物即平台期的荧光信号差异较大,重复性差,从而导致定量不准确,所以不适合用于定量分析。而指数期内荧光信号重复性好,所以用这个阶段的数据可以对靶标基因进行准确定量。另外,从指数期开始,试剂有剩余,DNA 聚合酶 的高效性强,产物量少。因此能提高数据的准确度。
下图1是一组 6 个梯度稀释的标准品,扩增曲线指数期之后是线性扩增期,从图上看,没有出现明显的平台期。这样的结果能否得到理想的标准曲线用于定量分析呢?
定量 PCR 的数学原理中指出,荧光定量 PCR 是在扩增曲线的指数期内划定阈值线,取阈值线与扩增曲线的交点所得到的 Ct 值(图 2)进行定量分析。之前的实验证明:96 次重复实验(图 3)说明 PCR 反应的终产物即平台期的荧光信号差异较大,重复性差,从而导致定量不准确,所以不适合用于定量分析。而指数期内荧光信号重复性好,所以用这个阶段的数据可以对靶标基因进行准确定量。另外,从指数期开始,试剂有剩余,DNA 聚合酶 的高效性强,产物量少。因此能提高数据的准确度。